Uzun zamandır migren tedavisinde botoks uygulaması etkin şekilde kullanılmaktadır. Bazı migren atakları sık olarak yaşanabilmekte ve bu ataklara bulantı, kusma, ışığa ve sese karşı hassasiyet gelişebilmektedir. Bu hastalarda doktor tarafından belirlenen bölgelere botoks enjekte edilerek kas ve sinirler arasında iletişimsizlik sağlanarak ağrıların önüne geçilmesi sağlanmaktadır.